長期吃三文魚一般會出現關節痛、加重腸胃負擔、拉肚子等危害。
細菌危害
不僅是三文魚，其他動物都存在着大量細菌。不過，細菌主要存在於消化系統中，所以一般來說生魚片中不存在細菌危害，但是細菌有可能會被人爲的轉移到肌肉組織中。
一般我們很難買到完整的三文魚，有些三文魚上了漁船之後，刀工師傅就會在第一時間清除掉它們的內臟和消化道，防止魚肉被細菌污染。
擡槓：畢竟是人爲操作，刀切來切去的，處理魚時是否會不小心，接觸到消化道的細菌，然後再接觸到魚肉，從而導致消化道的細菌發生轉移就不好說了，畢竟誰也不會派一個人上船上盯着，或者規定如何用刀，分別用幾把刀，每殺一條要如何清洗消毒，或者有什麼儀器可以檢測。
寄生蟲危害
要說魚肉裏面有什麼危害，那就是寄生蟲了。與細菌不同，它們的細胞更大，或者是多細胞生物，有複雜的生命週期。較大的病原體包括線蟲(扁形蟲)、蛔蟲，甚至多細胞寄生蟲。這些微生物不僅僅侷限於腸道。
在它們複雜的生命週期中，不同的生長階段會跑到不同的.宿主中成長。在三文魚中，寄生蟲會在魚的肌肉中鑽個洞，然後形成囊(充滿液體的小泡泡)，在這些囊中產卵。這些囊很小，比一粒米還小，很難發現，沒見哪個師傅會拿着小鑷子和放大鏡給你慢慢挑出來，
更別說是它們的卵了。好在寄生蟲無法忍受嚴寒，我們可以把它們凍死。冷凍後，它們的細胞會爆裂成魚體內無害的爆裂細胞。
因此在三文魚捕撈國家（丹麥、挪威、智利等）都有嚴格的冷凍標準，飯店和市場上提供給消費者的所有三文魚，甚至壽司，都必須冷凍到一定程度達到除魚體內潛伏的任何寄生蟲的標準。
一般的冷凍標準：
-20℃以下冷凍7天，-35°C以下直至凍成硬邦邦的固體，並在-35°C以下保存15小時，-35°C以下直至凍成硬邦邦的固體，並在-20°C以下保存24小時。
上飯店別鬧笑話：當你吃壽司或三文魚時，不要傻呵呵地問：“服務員，這三文魚新鮮不新鮮，怎麼感覺冰冰的，是不是凍過了，給我換一盤新鮮的，沒凍過的？”
大多數捕撈船，在船上處理掉內臟之後就會把三文魚放入-40°C的冰櫃中，從而達到瞬間冷凍，直到船靠岸。因此，當你吃新鮮的壽司和三文魚刺身時，一般來說都是冷凍魚。
當然標準是一回事，執行則是另外一回事。就像上文說的萬一被細菌污染了，冷凍可以幹掉寄生蟲，但並不一定能幹掉細菌，在寒冷的情況下，它們可能會進入冬眠，溫度上來了就變得活躍起來。而寄生蟲，
魚上船可能要經過供應商、經銷商、餐廳，在這期間如果每一個環節都想節約成本，船上冷凍溫度不夠，供應商可能會認爲經銷商拿回去再賣出去有個過程會進行冷凍，而經銷商認爲供應商已經按標準冷凍了，
或者認爲飯店拿回去反正也要冷凍，因此他們都沒有按照標準冷凍，一條魚沒經過嚴格的冷凍標準可能會直接呈現在餐桌之上。食品安全問題，我國像來是高標準，低......當然我這是吹毛求疵了，屬於極小概率的事情。
冷凍的更好吃
還有些人追求極致的“鮮”，比如隔壁日本人，八爪魚非得吃那種還在一扭一扭的，口味實在太重。
事實上，日本人曾做過味覺盲測，在一些美食家不知情的情況下品嚐冷凍過的三文魚和沒冷過的鮮魚，讓他們評選出味道更好的魚，
結果讓人大跌眼鏡，冷凍魚獲勝，但味蕾這東西因人而異。日本美食專家認爲魚被捕獲後立即進行冷凍，有助於鎖住魚的鮮味，不過冷凍得時間不能過長，否則會破壞肉的質感。
對於近期來說，大家最好老老實實的，別說買不到，能買到也別買。雖然病毒大概率不可能出現在三文魚上，這次可能是人爲操作時不小心轉移上去的，但是不怕一萬。病毒可凍不死，想想萬年冰川中的遠古病毒，
以及喜馬拉雅冰川融合科學家發現的病毒，小心駛得萬年船如果真想吃最起碼要56度以上，煮上30分鐘，在它每下鍋之前，你必然要與其接觸，也是兇險萬分。
可以吃，一定要是新鮮的
1、細菌感染：運輸三文魚的過程中，三文魚可能被細菌污染，足夠時長的高溫可以殺滅大部分細菌，如果未經高溫烹飪，生吃三文魚，可能發生細菌感染，從而導致發生急性胃腸炎，出現噁心、嘔吐、腹痛、腹瀉、發熱等症狀；
2、寄生蟲感染：三文魚身上可能存在異尖線蟲等寄生蟲，如果未經高溫烹飪，三文魚中的寄生蟲未被消除，生吃後可能發生感染，出現腹痛難忍的'症狀；
3、過敏：某些人可能對三文魚或其他海鮮過敏，生吃三文魚，其中的蛋白質未經高溫烹飪而未發生變性，可能增加過敏的發生概率。當患者出現過敏時可表現爲渾身瘙癢、腹痛、起疹子等，嚴重過敏者會出現喉頭水腫，可能會導致窒息而危及生命；
4、其他危害：對消化功能比較差的人，生吃三文魚對胃腸道是一種負擔，因爲未經過烹飪的食材，蛋白質相比熟食難以消化，且生冷食物可刺激胃腸道而產生噁心、嘔吐等症狀。如果三文魚生活的水域中存在重金屬污染，
無論是否生食，大量進食後都可能因重金屬攝入超標，而出現噁心、嘔吐、腹痛、血便等重金屬中毒症狀，嚴重時可能危及生命。
煮熟的食物容易消化，且高溫會殺死寄生蟲、細菌，因此建議生活中食用煮熟的食物，保證機體健康。如果想要生吃三文魚，建議在正規渠道購買，仔細挑選新鮮的三文魚，低溫密封保存，從而達到一定的殺菌效果。
