受限於目前疫苗的種類，並無法完全依賴疫苗來預防所有的疾病。凡一種新的疫苗能夠核可上市，必定具有一定的安全性與保護力，且要能夠有效降低目前疾病盛行率的疫苗，才值得研究發展並推廣上市。
而一種疫苗要列爲健保的常規接種項目，必須得符合國家防疫政策與經濟效益，接種項目也會因醫療現況而調整，例如：水痘疫苗自民國93年起納入健保給付，而麻疹疫苗則自今年初停止施打。目前仍列爲自費項目的疫苗，有些是政府衡量該種疾病在國內的盛行率較低，有些則是尚有其他較經濟的傳統型疫苗可供選擇。
由於目前已是全球化的時代，有些家庭因爲工作因素或是異國聯姻，會時常帶着孩子往返國內外，甚至在外地暫居：而隨着國人休閒品質的提升，帶孩子出國旅遊的機會也大增。在這樣的環境與社會變遷之下，相對的疾病的傳播交流也更顯得複雜。所以在政府未能全面提供免費施打這些自費疫苗之前，如果希望能讓自己的寶寶擁有全面性的保護（畢竟疾病盛行率低並不等於沒有罹病的機會），或是希望寶寶在接種疫苗之後，能夠降低副作用發生的機率，就必須自行衡量是否值得爲寶寶編列此筆自費疫苗的預算了。
