過敏結膜炎的症狀與急性結膜炎的症狀略有不同，除了發癢及流淚外，眼睛赤紅，分泌物粘稠程度並不像急性結膜炎那麼嚴重；不過眼結膜會有許多小濾泡及不同程度的水腫現象。
過敏結膜炎通常使用抗過敏藥物來治療。除了可用抗過敏藥物予以治療，避免接觸粉塵黴菌等各種明顯導致過敏的誘因，則是治本之道，尤其本身爲過敏體質者更應注意。許多患者感覺眼睛發癢或稍有不適時，即自行前往藥房購買眼藥水點用。從藥房購買的類固醇藥水，雖可迅速緩解過敏症狀，但長期使用的結果，將導致眼睛抵抗力降低，增加感染機率，甚至造成眼壓上升、青光眼、視神經萎縮等不可逆傷害。這一類的藥物最好在醫師診治監控之下使用，並先以其它抗敏感藥物治療，不宜自行以成藥緩解症狀，以免對眼睛產生更嚴重的傷害。
症狀特別嚴重，經過治療多年不愈的病人也可考慮易地療法，也就是從原先住的地區遷移到另外一個較遠的地區居住和生活，可能會收到較好的效果。這是因爲遷移到了異地，脫離了原居住地的過敏原的緣故。
