不管是藥物流產還是人工流產，風險都是有的，但是一般是不要緊的。如果胚胎長在疤痕處的話危險更大一些。藥物流產的話有個不好處就是流不乾淨還需要第二次清宮的。
藥物流產有危險的。藥物流產主要的危害是孕囊排出不完全，導致出血，有大出血的風險。藥物流產適用於終止49日以內的妊娠，就是使用藥物後身體內的孕酮活力下降，引起流產，再通過藥物使子宮發生強烈收縮，迫使妊娠組織排出體外。
如果有內分泌疾病（如腎上腺疾病、糖尿病、甲狀腺疾病等）、肝或腎功能異常、各種器官的良性或惡性腫瘤、血液病或血栓性疾病、高血壓、心臟病、青光眼、哮喘、胃腸功能紊亂、帶節育器、宮外孕患者不能藥物流產。
